Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC3

Cmtr1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtr1Q9DBC3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtr1Q9DBC3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms