Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms