Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pop5Q9DB28 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms