Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB16

Cab39l, Calcium-binding protein 39-like, mousemouse

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Length 337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39lQ9DB16 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Cab39lQ9DB16 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Cab39lQ9DB16 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cab39lQ9DB16 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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