Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms