Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp12Q9D9M2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms