Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9I4

Tbc1d20, TBC1 domain family member 20, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d20Q9D9I4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Tbc1d20Q9D9I4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Tbc1d20Q9D9I4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Tbc1d20Q9D9I4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Tbc1d20Q9D9I4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Tbc1d20Q9D9I4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Tbc1d20Q9D9I4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Tbc1d20Q9D9I4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Tbc1d20Q9D9I4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbc1d20Q9D9I4 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms