Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms