Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MsraQ9D6Y7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MsraQ9D6Y7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MsraQ9D6Y7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MsraQ9D6Y7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MsraQ9D6Y7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MsraQ9D6Y7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MsraQ9D6Y7 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MsraQ9D6Y7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MsraQ9D6Y7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MsraQ9D6Y7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MsraQ9D6Y7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MsraQ9D6Y7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MsraQ9D6Y7 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MsraQ9D6Y7 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MsraQ9D6Y7 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MsraQ9D6Y7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MsraQ9D6Y7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MsraQ9D6Y7 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MsraQ9D6Y7 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MsraQ9D6Y7 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MsraQ9D6Y7 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MsraQ9D6Y7 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MsraQ9D6Y7 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MsraQ9D6Y7 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MsraQ9D6Y7 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MsraQ9D6Y7 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MsraQ9D6Y7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MsraQ9D6Y7 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MsraQ9D6Y7 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MsraQ9D6Y7 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MsraQ9D6Y7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MsraQ9D6Y7 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MsraQ9D6Y7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MsraQ9D6Y7 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MsraQ9D6Y7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MsraQ9D6Y7 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MsraQ9D6Y7 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MsraQ9D6Y7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MsraQ9D6Y7 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MsraQ9D6Y7 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MsraQ9D6Y7 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MsraQ9D6Y7 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MsraQ9D6Y7 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MsraQ9D6Y7 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MsraQ9D6Y7 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MsraQ9D6Y7 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MsraQ9D6Y7 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MsraQ9D6Y7 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MsraQ9D6Y7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MsraQ9D6Y7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MsraQ9D6Y7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MsraQ9D6Y7 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MsraQ9D6Y7 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MsraQ9D6Y7 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MsraQ9D6Y7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MsraQ9D6Y7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MsraQ9D6Y7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MsraQ9D6Y7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MsraQ9D6Y7 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
MsraQ9D6Y7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MsraQ9D6Y7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MsraQ9D6Y7 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MsraQ9D6Y7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MsraQ9D6Y7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MsraQ9D6Y7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MsraQ9D6Y7 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MsraQ9D6Y7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MsraQ9D6Y7 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MsraQ9D6Y7 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MsraQ9D6Y7 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MsraQ9D6Y7 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MsraQ9D6Y7 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MsraQ9D6Y7 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MsraQ9D6Y7 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MsraQ9D6Y7 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MsraQ9D6Y7 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MsraQ9D6Y7 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MsraQ9D6Y7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MsraQ9D6Y7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MsraQ9D6Y7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MsraQ9D6Y7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MsraQ9D6Y7 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MsraQ9D6Y7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MsraQ9D6Y7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MsraQ9D6Y7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MsraQ9D6Y7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MsraQ9D6Y7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MsraQ9D6Y7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MsraQ9D6Y7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MsraQ9D6Y7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MsraQ9D6Y7 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MsraQ9D6Y7 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MsraQ9D6Y7 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MsraQ9D6Y7 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MsraQ9D6Y7 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MsraQ9D6Y7 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MsraQ9D6Y7 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MsraQ9D6Y7 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MsraQ9D6Y7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms