Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Borcs6Q9D6W8 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Borcs6Q9D6W8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Borcs6Q9D6W8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Borcs6Q9D6W8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Borcs6Q9D6W8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Borcs6Q9D6W8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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Borcs6Q9D6W8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
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Borcs6Q9D6W8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Borcs6Q9D6W8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms