Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Rab11fip1Q9D620 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Rab11fip1Q9D620 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Rab11fip1Q9D620 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Rab11fip1Q9D620 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Rab11fip1Q9D620 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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