Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms