Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Efhd1Q9D4J1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms