Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubgcp4Q9D4F8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms