Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.08■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.08■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.08■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.07■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.07■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.07■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.07■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.07■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.07■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.07■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933428M09RikQ9D3X3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms