Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gpn3Q9D3W4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpn3Q9D3W4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gpn3Q9D3W4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpn3Q9D3W4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gpn3Q9D3W4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpn3Q9D3W4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gpn3Q9D3W4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpn3Q9D3W4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gpn3Q9D3W4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gpn3Q9D3W4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gpn3Q9D3W4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gpn3Q9D3W4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gpn3Q9D3W4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpn3Q9D3W4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpn3Q9D3W4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpn3Q9D3W4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpn3Q9D3W4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpn3Q9D3W4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpn3Q9D3W4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpn3Q9D3W4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gpn3Q9D3W4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gpn3Q9D3W4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpn3Q9D3W4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpn3Q9D3W4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gpn3Q9D3W4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpn3Q9D3W4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gpn3Q9D3W4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpn3Q9D3W4 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpn3Q9D3W4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpn3Q9D3W4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpn3Q9D3W4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpn3Q9D3W4 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gpn3Q9D3W4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms