Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pus10Q9D3U0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms