Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stag1Q9D3E6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms