Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms