Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim42Q9D2H5 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim42Q9D2H5 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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