Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syf2Q9D198 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms