Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms