Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms