Protein–RNA interactions for Protein: Q9D103

Ifitm1, Interferon-induced transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm1Q9D103 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ifitm1Q9D103 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Ifitm1Q9D103 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Ifitm1Q9D103 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Ifitm1Q9D103 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Ifitm1Q9D103 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Ifitm1Q9D103 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Ifitm1Q9D103 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Ifitm1Q9D103 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
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Ifitm1Q9D103 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ifitm1Q9D103 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms