Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms