Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm12Q9D0R8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms