Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I4

Stx17, Syntaxin-17, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx17Q9D0I4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Stx17Q9D0I4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Stx17Q9D0I4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx17Q9D0I4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx17Q9D0I4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx17Q9D0I4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx17Q9D0I4 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx17Q9D0I4 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx17Q9D0I4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx17Q9D0I4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx17Q9D0I4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx17Q9D0I4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx17Q9D0I4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx17Q9D0I4 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx17Q9D0I4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx17Q9D0I4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx17Q9D0I4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx17Q9D0I4 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms