Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mms19Q9D071 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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