Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW6

Rnf146, E3 ubiquitin-protein ligase RNF146, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf146Q9CZW6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms