Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shmt2Q9CZN7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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