Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thumpd2Q9CZB3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms