Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYA6

Zcchc8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc8Q9CYA6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms