Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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