Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV82

2310003L06Rik, RIKEN cDNA 2310003L06 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310003L06RikQ9CV82 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2310003L06RikQ9CV82 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2310003L06RikQ9CV82 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms