Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Klhl28Q9CR40 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl28Q9CR40 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.6 ms