Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms