Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
PompQ9CQT5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PompQ9CQT5 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms