Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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