Protein–RNA interactions for Protein: Q99PJ2

Trim8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim8Q99PJ2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms