Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH8

Trem2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem2Q99NH8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trem2Q99NH8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms