Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NsmfQ99NF2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms