Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms