Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms