Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms