Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE3

Lysmd3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd3Q99LE3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms