Protein–RNA interactions for Protein: Q99LB7

Sardh, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SardhQ99LB7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SardhQ99LB7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SardhQ99LB7 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SardhQ99LB7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SardhQ99LB7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SardhQ99LB7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SardhQ99LB7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SardhQ99LB7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SardhQ99LB7 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SardhQ99LB7 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SardhQ99LB7 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SardhQ99LB7 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SardhQ99LB7 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SardhQ99LB7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SardhQ99LB7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SardhQ99LB7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SardhQ99LB7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SardhQ99LB7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SardhQ99LB7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SardhQ99LB7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SardhQ99LB7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SardhQ99LB7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SardhQ99LB7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SardhQ99LB7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SardhQ99LB7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SardhQ99LB7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SardhQ99LB7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SardhQ99LB7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SardhQ99LB7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SardhQ99LB7 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SardhQ99LB7 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SardhQ99LB7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SardhQ99LB7 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SardhQ99LB7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SardhQ99LB7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SardhQ99LB7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SardhQ99LB7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SardhQ99LB7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SardhQ99LB7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SardhQ99LB7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SardhQ99LB7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SardhQ99LB7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SardhQ99LB7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SardhQ99LB7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SardhQ99LB7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SardhQ99LB7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SardhQ99LB7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SardhQ99LB7 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SardhQ99LB7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SardhQ99LB7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SardhQ99LB7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SardhQ99LB7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms