Protein–RNA interactions for Protein: Q99KS2

Ngrn, Neugrin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgrnQ99KS2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NgrnQ99KS2 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms