Protein–RNA interactions for Protein: Q99JR8

Smarcd2, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd2Q99JR8 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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Smarcd2Q99JR8 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smarcd2Q99JR8 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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Smarcd2Q99JR8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcd2Q99JR8 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcd2Q99JR8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Smarcd2Q99JR8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcd2Q99JR8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcd2Q99JR8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Smarcd2Q99JR8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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