Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms