Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Def8Q99J78 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms